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PCR實(shí)驗(yàn)總被污染?這些污染源識(shí)別小技巧請(qǐng)收好
點(diǎn)擊次數(shù):129 更新時(shí)間:2025-12-25

PCR技術(shù)因具有很高靈敏度和強(qiáng)大擴(kuò)增能力,極易受到微量核酸污染的影響,導(dǎo)致假陽(yáng)性結(jié)果。因此,準(zhǔn)確識(shí)別污染源對(duì)保障檢測(cè)結(jié)果可靠性至關(guān)重要。污染不僅影響科研數(shù)據(jù),也可能波及臨床診斷或藥品安全檢測(cè)。

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污染源類(lèi)型與識(shí)別方法

PCR實(shí)驗(yàn)室主要存在四大類(lèi)污染源,其對(duì)應(yīng)的識(shí)別方法如下:

污染源類(lèi)型

主要來(lái)源

識(shí)別/監(jiān)測(cè)方法

關(guān)鍵差異

樣本間交叉污染

容器污染、密封不嚴(yán)溢出、移液器交叉使用、氣溶膠擴(kuò)散

設(shè)置陰性對(duì)照;檢查操作流程(如是否更換槍頭);空氣沉降菌檢測(cè)

多發(fā)生在樣本制備階段,可通過(guò)規(guī)范操作顯著降低

PCR試劑污染

試劑配制時(shí)被模板或陽(yáng)性對(duì)照污染,尤其是加樣槍、容器、雙蒸水等

使用空白對(duì)照(無(wú)模板DNA的反應(yīng)體系);定期對(duì)試劑進(jìn)行PCR檢測(cè)

若空白對(duì)照陽(yáng)性,則提示試劑或配制過(guò)程受污染

擴(kuò)增產(chǎn)物污染

擴(kuò)增后反應(yīng)管泄漏、開(kāi)蓋產(chǎn)生氣溶膠,一個(gè)顆粒可含48,000拷貝DNA

陰性對(duì)照出現(xiàn)目標(biāo)條帶;環(huán)境表面拭子PCR檢測(cè);加強(qiáng)通風(fēng)與紫外消毒

是zui常見(jiàn)且zui難清除的污染源,因產(chǎn)物拷貝量極大

克隆質(zhì)粒污染

作為陽(yáng)性質(zhì)控品的重組質(zhì)粒意外外溢

在非使用質(zhì)粒區(qū)域檢出目標(biāo)序列;通過(guò)特異性引物區(qū)分質(zhì)粒與天然序列

常見(jiàn)于頻繁使用陽(yáng)性對(duì)照的檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室

(補(bǔ)充說(shuō)明)部分文獻(xiàn)還提到操作者皮膚、頭發(fā)或?qū)嶒?yàn)服可能帶來(lái)污染,但此類(lèi)情況相對(duì)少見(jiàn)。

監(jiān)測(cè)與驗(yàn)證實(shí)踐

1設(shè)立對(duì)照:每次實(shí)驗(yàn)必須包含陰性對(duì)照(無(wú)模板)和陽(yáng)性對(duì)照,以監(jiān)控試劑污染與反應(yīng)有效性。

2環(huán)境監(jiān)測(cè):定期采集臺(tái)面、離心機(jī)、移液器等表面樣本,進(jìn)行PCR檢測(cè)以發(fā)現(xiàn)隱匿污染。

3設(shè)備校準(zhǔn):移液器應(yīng)定期校準(zhǔn)(誤差控制在5%以?xún)?nèi)),防止因加樣不準(zhǔn)引發(fā)異常結(jié)果。

4記錄追蹤:詳細(xì)記錄每次監(jiān)測(cè)的時(shí)間、點(diǎn)位與結(jié)果,有助于追溯污染源頭。

識(shí)別PCR污染需結(jié)合實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)控制(如設(shè)置多種對(duì)照)與環(huán)境主動(dòng)監(jiān)測(cè)。一旦發(fā)現(xiàn)污染,應(yīng)立即暫停實(shí)驗(yàn),排查并清潔所有可能接觸過(guò)的器材與空間。建立“污染源識(shí)別—技術(shù)鑒別—系統(tǒng)防控"三位一體的體系,可顯著降低污染發(fā)生率